受精卵在子宫体腔以外着床称为异位妊娠，习称宫外孕。其中95%为输卵管妊娠。尽管胚胎移植术将胚胎直接放入宫腔内，但仍不能避免宫外孕的发生，因为胚胎在宫腔内仍处于游走状态，而且子宫允许受精卵着床有着严格的窗口期，也就是“着床窗期”，只有两者同步发育且功能协调，才能完成受精卵着床。
试管婴儿助孕后宫外孕发生率约2-3%，其中既往有输卵管炎症、输卵管妊娠史或手术史者为高危人群。对于此类患者，为杜绝宫外孕，助孕前是否需行输卵管切除呢?
医学上根据输卵管的形态，由内向外分为4部分：间质部、峡部、壶腹部及伞部。一般输卵管切除是指切除峡部、壶腹部及伞部这3部分，而间质部是输卵管穿行于子宫肌壁内的部分，无法切除，就像“斩草不能除根”。所以输卵管切除后，胚胎依然可能种植在输卵管特殊位置间质部，导致宫外孕。输卵管间质部妊娠发病率为1/2500—1/5000，占所有输卵管妊娠2%~6%。此外，胚胎也可能种植在卵巢、腹腔、阔韧带、宫颈等罕见部位。
随着医疗水平的进步，血HCG测定及B超诊断对宫外孕早期诊断帮助很大，一经诊断，应尽早处理，避免病灶破裂出血危及生命，减少住院时间及住院费用。
所以试管也是有宫外孕的风险的存在的，相对于自然怀孕，试管宫外孕的概率会更低。
